Bob Marley, genomics, and a rare form of melanoomas

toukokuussa 1981 musiikkimaailma menetti legendansa, kun reggae-artisti Bob Marley kuoli neljän vuoden taistelun jälkeen hänen varpaastaan alkaneeseen melanooman ihosyöpään.

tämä voi tuntua oudolta, sillä melanoomaan liittyy yleensä vaalea iho ja altistuminen auringon UV-säteilylle. Mutta itse asiassa Marleylla todettiin harvinainen, mutta nopeasti kasvava ihosyöpä, joka tunnetaan nimellä acral melanooma, joka ei ole vahvasti yhteydessä UV-altistukseen.

nämä kasvaimet on nimetty sijaintinsa – kämmenissä, jalkapohjissa ja kynsien alla olevan karvattoman akraalinahkan – mukaan, ja ne ovat hyvin erilaisia kuin suurin osa melanoomista, joita esiintyy muualla ihon karvaisissa osissa, joita kutsutaan ”ihonalaisiksi” melanoomiksi.

on olemassa muutama muukin epätavallinen melanoomatyyppi: silmässä kasvavat okulaariset (uveaaliset) melanoomat sekä limakalvomelanoomat, jotka alkavat kehon limaa tuottavilla pinnoilla, kuten suussa tai nenässä. Nämä ovat myös paljon harvinaisempia kuin Ihomelanooma.

mikä sitoo nämä kasvaimet yhteen ja tekee niistä kaikki melanoomat on se, että ne kaikki syntyvät rogue pigmentti tuottavia soluja löytyy ihon ca;; ed melanosyyttien. Niiden tuottama pigmentti, melaniini, on pääasiassa vastuussa ihon ja hiusten väristä ja auttaa suojaamaan meitä auringon UV-säteiltä.

mutta vaikka niiden biologiset juuret voivat olla samat, niiden välillä on keskeisiä eroja, jotka vaikuttavat siihen, miten ne kasvavat ja leviävät elimistössä ja miten ne reagoivat hoitoon.

joten selvittääksemme lisää näistä epätavallisista syövistä – ja selvittääksemme, miten parhaiten niitä voidaan hoitaa – tutkijamme Manchesterin syöpätutkimuskeskuksessa professori Richard Marais ’ n johdolla ovat tutkineet genetiikan maailmaa.

erilaiset geenivirheet

kun Bob Marley kuoli 80-luvulla, professori Maraisin ja hänen ryhmänsä nyt käytettävissä olevat geenianalyysitekniikat olisivat tuntuneet kaukaiselta tulevaisuudelta.

nykyaikaiset edistysaskeleet tutkijoiden kyvyssä analysoida eli ”sekvenssissä” olevaa DNA: ta mullistavat käsitystämme monista syöpätyypeistä. Se on nyt mahdollista ’lukea’ kaikki geneettinen informaatio sisällä solujen kasvaimen (sen genomi) muutamassa päivässä, paljastaen luettelo geenivirheitä ne kantavat.

ja uudessa julkaisussa Pigment Cell & Melanoomatutkimus professori Marais ryhmineen on tutkinut yksityiskohtaisesti viideltä potilaalta otettujen akraalimelanoomanäytteiden genomeja. He liittivät tämän tietoihin kolmesta muusta akraalisesta melanoomasta, jotka he olivat aiemmin analysoineet (yhteensä kahdeksan), ja vertasivat löydöksiä tietoihin viidestä limakalvosta, 12 uveaalista ja 25 ihon melanoomasta.

heidän analyysinsä paljasti, että akraalimelanooman geenivirheet eroavat hyvin paljon näistä muista ihosyöpätyypeistä.

ihomelanooman DNA: ssa on kymmeniätuhansia ”kirjoitusvirheitä” DNA – koodissa-yksittäisiä yksittäisiä muutoksia hajallaan ympäri syövän DNA: ta. Sen sijaan useimmissa akraalisissa melanoomissa oli vähemmän näitä yhden kirjaimen geenivirheitä. Sen sijaan suuret DNA – palaset olivat irronneet ja kiinnittyneet toisaalle-vähän kuin suuria tekstiosia olisi satunnaisesti leikattu ja liitetty koko asiakirjaan. Muut osat puuttuivat kokonaan.

tutkittuaan tiettyjä geenejä tutkijat havaitsivat, että nämä akraalimelanoomien vääristymät johtivat mutaatioihin useissa ”tavallisissa epäillyissä”, jotka on yhdistetty myös muihin syöpätyyppeihin. Tällaisia ovat muun muassa BRAFIKSI ja KITIKSI kutsutut geenit, joiden tiedetään jo olevan viallisia ihomelanoomassa.

professori Marais ryhmineen havaitsi myös joukon muita viallisia geenejä eri melanoomanäytteissä, mukaan lukien mutaatiot geeneissä p53, PTEN, NRAS ja APC – jotka kaikki ovat tunnettuja syyllisiä, jotka voivat aiheuttaa solujen hallitsematonta kasvua ja johtaa syöpään.

mikä tekee näistä kasvaimista erillisiä?

mikä aiheuttaa erilaisia melanoomia?

tutkijat löysivät myös kiehtovaa tietoa erilaisten melanoomatyyppien mahdollisista syistä. Se on ollut tiedossa jo jonkin aikaa, että syövät karvaisella iholla kuljettaa tunnusomaisia tunnusmerkkejä vaurioita niiden DNA ultravioletti (UV) säteet auringosta tai aurinkotuoleja. Laajoista tutkimuksista selviää myös, että UV-säteily on merkittävä riskitekijä näille kasvaimille.

mutta vaikka professori Marais ryhmineen löysi aiemmin todisteita tällaisesta DNA-vauriosta pari vuotta sitten otetusta näytteestä ja laboratoriossa kasvatetuista akraalimelanoomien soluista, tässä uusimmassa tutkimuksessa otetuissa akraalisissa kasvainnäytteissä ei ollut UV-vaurion tunnusmerkkejä. Tämä viittaa siihen, että vaikka UV-altistus voi olla rooli joidenkin potilaiden acral melanoomat, se ei ole merkittävä ajo tekijä.

toinen mielenkiintoinen havainto heidän analyysistään on, että akraali – ja limakalvomelanoomat näyttävät olevan suurin piirtein samanlaisia geneettisten vaurioiden määrän ja tyypin suhteen – molemmilla on vähemmän kuin ihon melanoomat-kun taas uveaaliset melanoomat ovat taas erilaisia. Näillä silmäsyövillä näyttää olevan erityisen vähän geneettistä kaaosta sisällään, ja niiden viat ovat todennäköisesti peräisin eri lähteestä.

siirtyminen pois ”one size fits all”

musiikkimaailmassa nähtäneen liian yksinkertaistettuna kaikkien artistien ryhmittelynä yhden sateenvarjon alle. Marleyn ja muiden artistien uranuurtaman reggae-pohjaisen musiikin sisälläkin on liuta tyylilajeja juurista rokkareihin, dubista dancehalliin.

kuten olemme aiemmin kirjoittaneet, syöpätutkimuksen ja-hoidon maailmassa siirrymme pois ”one size fits all” – lähestymistavasta siihen, miten kohdistamme taudin, ja keskitymme sen sijaan yksittäisen potilaan sairauden perimään.

tämä tutkimus, ja enemmänkin sitä tehdään ympäri maailmaa, avaa syövän ”mustan laatikon” ja haastaa meidät ajattelemaan uudella tavalla. Syövän eri tyyppejä ja alatyyppejä ajavien yksittäisten geenivirheiden ymmärtäminen on avain syövän tehokkaampaan hoitoon tulevaisuudessa.

erityisesti erilaisten melanoomatyyppien taustalla olevien viallisten geenien selvittäminen on elintärkeää, jotta löydettäisiin tehokkaampia tapoja hoitaa näitä aggressiivisia sairauksia. Esimerkiksi lääke vemurafenib (tunnetaan myös nimellä Zelboraf) kohdistuu vikoja BRAF geeni, ja muita tällaisia geeneihin kohdennettuja hoitoja on kehitteillä.

mutta tämä ei ole vailla haasteitaan. Olemme nyt selvittämässä, että syövän geneettinen monimutkaisuus voi vaihdella potilaan kehossa ja jopa saman kasvaimen sisällä. Ja nämä viat voivat myös muuttua ja kehittyä sairauden kasvaessa, mikä auttaa sitä kehittämään vastustuskykyä hoitoon.

on myös paljon työtä tehtävänä selvittää, miten parhaiten voidaan käyttää uusia geneettisesti kohdennettuja hoitoja eloonjäämisen parantamiseksi (mitä alamme tehdä uudessa Keuhkomatriisitutkimuksessamme). Kun otetaan huomioon syöpälääkkeiden kustannuksia koskevat viimeaikaiset otsikot, tämä on selvästi sekä poliittinen että taloudellinen haaste että tieteellinen haaste.

mutta jokaisen uuden tutkimuspaperin myötä rakennamme kasvavaa karttaa monimutkaisista sairauksista, joita kutsumme syöväksi. Uskomme, että se johtaa uusiin parannuskeinoihin, jotka voivat vaikuttaa potilaisiin kaikkialla.

Kat

Leave a Reply

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.