Questo zoo di 49 acri è stato fondato nel 1868 con un dono di due cigni dai commissari di Central Park a quelli di Lincoln Park, dove si trova lo zoo. Situato al centro del parco, i motivi dello zoo sono stati progettati dagli architetti paesaggisti Swain Nelson e Olaf Benson alla fine del XIX secolo. Nel 1877 fu creato il Birch Canal, che collegava il North Pond di Lincoln Park ad altri corpi idrici, che furono poi rimodellati e designati Swan Pond e Waterfowl Lagoon. Intorno a questi giochi d ” acqua costruiti, diversi recinti di animali e gli edifici sono stati costruiti, e lo zoo si è evoluto per includere giardini vittoriani, topografia ondulata, sentieri serpeggianti, ponti rustici, e stand di alberi maturi. Piuttosto che essere separati dal più grande paesaggio del Lincoln Park, le collezioni zoologiche sono state integrate nel parco senza recinzioni o tasse di ammissione. All’inizio del 1900, i recinti per orsi, bisonti, uccelli e leoni marini furono completati da padiglioni, ristoranti, stazioni di comfort e il Café Brauer in stile Prairie, progettato da Dwight Perkins e completato nel 1908. Dal 1930, quando la Works Progress Administration è stato coinvolto nella raffinatezza del paesaggio dello zoo, recinti per rettili e primati erano stati aggiunti.
Dal 1945 al 1962, Marlin Perkins fu direttore dello zoo, incoraggiando i recinti naturalistici e formando la Lincoln Park Zoological Society. Uno zoo per bambini tutto l’anno e il” Farm-in-the-Zoo ” erano in vigore nel 1965. Nel 2003, Portico Group ha progettato un habitat africano per grandi mammiferi e primati. Nel 2010, Studio Gang ha rivitalizzato il paesaggio che circonda il South Pond con la creazione di una zona umida, aule all’aperto e una passerella. Oggi, lo zoo ospita più di 1.100 animali nel cuore di Lincoln Park.